قد أعدت الخطط الدراسية لتخصص الآثار المصرية وفق منظور شامل يركز على التكوين العلمي والمعرفي للطالب، كما يركز أيضًا على ربط التكوين المعرفي بالمهارة من خلال تعلم اللغات وتقنية المعلومات، ومن خلال التجربة عبر التدريب والممارسة العملية الميدانية. وتتميز مقررات القسم بمواكبتها لأحدث التطورات العلمية والأكاديمية في الدراسات الأثرية بفروعها المختلفة، فهي تضم إلى جانب دراسات الآثار القديمة والتعرف على النظريات الحديثة في علم الآثار، كما يقوم القسم بأعمال التدريب الميداني في مواقع الحفائر العلمية بالاشتراك مع وزارة السياحة والآثار.